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亞馬遜云科技宣布助力科學(xué)家僅用11天成功識(shí)別出超13萬種新的RNA病毒

2022-03-09 11:38:30來源:TechWeb

3月9日消息,亞馬遜云科技宣布近期與加拿大不列顛哥倫比亞大學(xué)云創(chuàng)新中心(UBC CIC)達(dá)成合作,基于亞馬遜云科技構(gòu)建的超級(jí)計(jì)算平臺(tái),助力國(guó)際科學(xué)家團(tuán)隊(duì)在短短11天內(nèi)搜索了近600萬份公開可用的生物樣本,成功識(shí)別出超過13萬種新的RNA病毒,其中包括9種新型冠狀病毒。

在亞馬遜云科技助力下,UBC CIC團(tuán)隊(duì)和全球計(jì)算病毒學(xué)家啟動(dòng)了The Open Virome(開放病毒組)項(xiàng)目,創(chuàng)建了開放的病毒發(fā)現(xiàn)云計(jì)算平臺(tái)Serratus。目前,該研究成果已經(jīng)發(fā)表在科學(xué)雜志《自然》上,同時(shí)還創(chuàng)建了公開的病毒數(shù)據(jù)庫,向全球科學(xué)界分享研究成果,幫助加速對(duì)RNA病毒的研究。

據(jù)介紹,The Open Virome項(xiàng)目的研究人員僅用8周時(shí)間,順利地在亞馬遜云科技上構(gòu)建超級(jí)計(jì)算平臺(tái)。借助亞馬遜云科技卓越的彈性計(jì)算能力,他們能夠快速處理數(shù)百萬GB的數(shù)據(jù),并且獲得了顯著的成本效益。該團(tuán)隊(duì)在亞馬遜云科技Amazon Simple Storage Service(Amazon S3)中鏡像了病毒基因測(cè)序數(shù)據(jù)庫SRA,之后使用亞馬遜云科技彈性計(jì)算云實(shí)例Amazon Elastic Compute Cloud (Amazon EC2)來分析數(shù)據(jù)集。

最終,在11天內(nèi),該團(tuán)隊(duì)就處理了高達(dá)570萬個(gè)測(cè)序數(shù)據(jù)集,僅花費(fèi)了2.4萬美元,發(fā)現(xiàn)了13萬個(gè)新的RNA病毒。在此之前,科學(xué)家們經(jīng)過幾十年的數(shù)據(jù)分析,只發(fā)現(xiàn)了1.5萬種病毒。The Open Virome項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)使用亞馬遜云科技的基礎(chǔ)架構(gòu)和服務(wù)后,在發(fā)現(xiàn)新病毒方面已經(jīng)為科學(xué)界節(jié)省了數(shù)百萬美元和長(zhǎng)達(dá)數(shù)年的時(shí)間。

另外,通過基于亞馬遜云科技搭建的Serratus平臺(tái),研究人員相信他們既能識(shí)別潛在的有害新病毒,又能提醒科學(xué)家注意導(dǎo)致新冠肺炎病毒SARS-CoV-2 virus的潛在突變,幫助改善診斷測(cè)試和疫苗開發(fā),為醫(yī)療政策決策者提供更有效的指導(dǎo)。

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